儿童腺样体肥大手术相对安全，但仍可能存在一些后遗症。一般来说，术后少数儿童可能出现出血情况，发生率较低，约在1%~2%左右。
出血问题
术后早期出血： 通常在术后24小时内可能发生，多与手术操作时止血不彻底等因素有关。表现为鼻腔有鲜血流出，若出血量少，可通过局部压迫等措施缓解；若出血量较多，需及时处理。远期少量出血： 个别儿童可能在术后数周甚至数月出现少量鼻出血，可能与局部创面愈合过程中轻微损伤等有关，但相对较少见。
感染风险
伤口局部感染： 术后如果护理不当，比如鼻腔卫生清洁不佳等，可能导致手术部位发生感染，表现为局部红肿、疼痛，伴有发热等症状。一般发生率在3%左右，如果发生感染需使用抗生素等进行抗感染治疗。呼吸道感染： 儿童腺样体肥大术后，机体抵抗力可能短时间内有所下降，容易引发呼吸道感染，如感冒、支气管炎等，这与儿童自身免疫功能尚未完全发育成熟等因素有关。
鼻腔粘连
轻度粘连： 可能没有明显症状，或者仅有轻微鼻塞等表现。一般在术后1~2周内如果发现及时，可通过局部分离等简单处理缓解。重度粘连： 较为少见，但可能会严重影响鼻腔通气，导致儿童出现明显鼻塞、呼吸不畅等症状，需要再次手术分离粘连组织，发生率约为0.5%左右。
腺样体残留或复发
残留情况： 手术中可能存在腺样体组织残留，发生率约为5%，残留的腺样体组织可能会导致相关症状再次出现，如鼻塞、打鼾等。复发情况： 少数儿童术后可能出现腺样体复发，一般在术后数月至数年发生，复发原因可能与个体体质等因素有关，复发后可能需要再次评估是否需要进一步治疗。