宝宝出生时患有血管瘤的原因主要有以下几点：
1.胚胎发育过程中出现血管发育异常：在胚胎发育过程中，血管的形成和发育出现异常，可能导致血管内皮细胞增生和血管腔形成异常，从而形成血管瘤。
2.雌激素水平升高：怀孕时，孕妇体内的雌激素水平会升高，这可能会影响胎儿的血管发育，导致血管瘤的形成。
3.其他因素：宝宝出生时患有血管瘤还可能与其他因素有关，如遗传因素、血管内皮细胞生长因子表达异常等。
需要注意的是，大多数血管瘤会在宝宝出生后的几个月到几年内逐渐消退，但有些血管瘤可能会持续存在或生长，需要进行治疗。如果宝宝出生时患有血管瘤，建议及时咨询医生，了解具体的情况和治疗方案。