念珠菌性龟头炎通常不易治愈，需规律且有效治疗。其属于真菌性龟头炎，难治原因包括：一、它是一种条件致病菌，正常情况下真菌不会引发感染，只有当人体出现免疫下降或正常菌群遭破坏时，才会致使念珠菌或真菌繁殖进而导致感染，如人体口服免疫抑制剂、伴有糖尿病，或长期大量口服抗菌素致正常菌群被破坏时，就可能合并真菌感染，且一旦感染往往较难清除；二、真菌感染时用药疗程不足会使感染难以控制，有时使用抗真菌药物短期起效后就停止用药，而正规抗真菌治疗至少需两周，即便症状完全消失后仍要按疗程治疗，复查真菌转为阴性才可停药，若症状缓解就停药，可能真菌尚未完全根治，从而导致龟头炎长期不愈；三、若合并包皮过长或包茎等情况，会造成局部慢性缺氧而利于真菌繁殖，进而导致真菌感染长期不愈，所以进行抗真菌感染同时，需进行包皮环切手术以减少局部慢性缺氧和遮盖，才能实现彻底治愈。
总之，念珠菌性龟头炎难治主要是因为其作为条件致病菌、用药疗程不足以及存在包皮相关问题等，要有效治愈需综合考虑这些因素并采取相应措施。