胃反流性食管炎比较典型的症状是烧心，大约有50%~70%的患者会出现，通常是在进食后1小时左右出现胸骨后或剑突下的烧灼感，可向颈部、肩部放射。另外一个常见症状是反流，约有60%~70%的患者会有反流表现，就是胃内容物在无恶心和不用力的情况下涌入咽部或口腔的感觉，有时呈酸味或仅为酸水。
食管部位的相关症状
胸痛： 胸痛也是胃反流性食管炎的常见症状之一，疼痛部位多在胸骨后，严重时可表现为剧烈刺痛，可放射到心前区、后背、肩部等部位，容易被误诊为心绞痛。一般疼痛发生在进食后，尤其是平卧、弯腰或腹压增高时更容易发作。吞咽困难： 部分患者会出现吞咽困难的情况，初期可能是因为食管炎引起食管痉挛导致间歇性吞咽困难，后期可能因食管瘢痕形成狭窄，出现持续性吞咽困难，而且固体和液体食物都可能受到影响。
食管外的相关症状
咳嗽： 胃反流性食管炎可能会引起咳嗽，这是因为反流物刺激或损伤食管以外的组织，如咽喉、气管等。这种咳嗽一般比较顽固，多为慢性咳嗽，夜间咳嗽可能会比较明显，有时容易被当作支气管炎等疾病来治疗，但效果不佳。咽喉不适： 患者可能会感觉咽喉部有异物感、堵塞感，还可能出现声音嘶哑的情况。这是由于反流物刺激咽喉部黏膜，导致咽喉部炎症、水肿等，长期的咽喉不适还可能增加患咽喉炎、声带息肉等疾病的风险。哮喘： 少数胃反流性食管炎患者会合并哮喘，反流物刺激气道，引起气道痉挛、狭窄等，从而诱发哮喘发作。这类患者往往哮喘症状与进食有关，而且常规的哮喘治疗效果可能不太理想。
其他不典型症状
口腔问题： 有的患者会出现口腔异味，这是因为反流的胃酸等胃内容物反流至口腔，长时间刺激口腔导致。另外，还可能出现牙齿酸蚀症，长期的胃酸反流会腐蚀牙齿，使牙齿表面的珐琅质受损，出现牙齿变色、缺损等情况。睡眠障碍： 由于烧心、反流等症状在夜间平卧时可能会加重，患者会因为不适而频繁醒来，影响睡眠质量，导致睡眠不足，进而可能出现白天困倦、注意力不集中等问题，长期的睡眠障碍还可能对身体的整体健康产生不利影响。