HPV阳性16时，目前并没有特定的“最佳”特效药物能直接清除HPV16病毒。但可以使用一些辅助增强免疫力的药物来帮助机体清除病毒，比如干扰素类药物。一般来说，使用干扰素治疗可能需要持续一段时间，比如几周甚至几个月不等。
干扰素类药物作用
重组人干扰素α-2b凝胶：它可以通过与细胞表面的受体结合，激活细胞内抗病毒蛋白基因，抑制病毒复制，从而发挥一定的抗病毒作用，帮助机体尝试清除HPV16感染。不过它不能直接杀灭HPV16病毒，但能调节机体免疫，促进免疫系统对病毒的清除。
增强免疫力相关药物
转移因子口服溶液：转移因子能够将供体的免疫信息传递给受体的淋巴细胞，增强受体的细胞免疫功能。它可以辅助机体的免疫系统更好地去应对HPV16的感染，帮助提高免疫力来清除病毒，但它不是针对HPV16的特异性药物。胸腺肽肠溶片：胸腺肽可以促使T淋巴细胞成熟，增强T细胞对抗原的反应，从而提高机体免疫功能。对于HPV16阳性的患者，它能在一定程度上辅助免疫系统发挥作用，帮助机体清除病毒，但同样不能直接针对HPV16进行杀灭。
注意事项
特殊人群：孕妇使用干扰素类药物需谨慎，应在医生评估利弊后决定是否使用。儿童使用转移因子口服溶液和胸腺肽肠溶片等药物时，要严格按照儿童的剂量来使用，因为儿童的身体代谢等情况与成人不同，不能随意用药。药物联合使用：一般不建议自行随意联合多种药物使用，因为药物之间可能存在相互作用，需要在医生的指导下根据患者具体的身体状况来合理搭配药物，避免不必要的风险。而且使用这些药物期间，要定期复查HPV情况以及相关的宫颈细胞变化等，以便医生及时调整治疗方案。