海马丸的功效和作用目前在正规医疗领域中并没有广泛且明确被大众熟知的统一功效界定。一般来说，从传统认知角度，海马有一定补肾壮阳、调气活血等作用，但以海马为主要成分的海马丸如果没有经过严格科学验证其确切功效。
从传统认知角度的相关推测
补肾壮阳方面： 传统认为海马有一定补肾作用，可能被部分观点认为对于肾阳不足等情况有一定辅助作用，但这并没有经过大规模临床双盲试验的充分验证。比如传统古籍中记载海马可用于肾虚阳痿等情况，但这只是基于传统经验的说法。调气活血方面： 有观点觉得海马丸可能对气血不畅等有一定调节作用，但这缺乏现代循证医学的充分证据支持。
现代医学角度的考量
缺乏明确临床证据： 目前现代医学领域并没有大量的临床研究数据表明海马丸能确切治疗某种特定的现代医学疾病。在正规的医疗指南和权威医学文献中，并没有将海马丸列为常规推荐用于治疗某类疾病的药物。不能替代正规药物： 如果患有疾病，不能依赖海马丸来进行正规治疗。比如患有肾病等疾病，需要根据具体的病情，通过正规的实验室检查、影像学检查等明确诊断后，采取如激素治疗、透析等正规医学手段，而不是寄希望于没有充分科学验证的海马丸。
特殊人群需谨慎
儿童群体： 儿童身体处于生长发育阶段，目前没有证据表明海马丸适合儿童使用，而且儿童对药物的耐受和反应与成人不同，随意使用可能会带来未知的健康风险。孕妇及哺乳期女性： 孕妇和哺乳期女性的身体状况特殊，海马丸对她们身体的影响不明确，为了避免可能对胎儿或婴儿产生不良影响，这类人群不建议自行使用海马丸，如需相关调理应在医生的专业评估下进行。