打完乙肝疫苗后，少数人可能出现不良反应。一般来说，常见的不良反应多在接种后24-48小时内出现。
局部不良反应
注射部位疼痛：接种乙肝疫苗后，约10%-20%的人会出现注射部位疼痛，多数比较轻微，无需特殊处理，1-2天可自行缓解。局部红肿： 约5%-10%的人会出现注射部位红肿，红肿范围一般较小，直径多在2.5cm以内，同样多数在1-2天内消退。
全身不良反应
发热： 接种后可能出现发热，一般为低热，体温多在37.5℃-38.5℃之间，约有5%-10%的人会出现这种情况，通常持续1-2天可自行恢复。乏力： 部分人会感到全身乏力，一般程度较轻，不影响正常生活，多数在1-2天内缓解。
过敏相关不良反应
皮疹： 极少数人可能出现皮疹，表现为皮肤出现红色斑丘疹等，一般在接触疫苗后数小时至数天内出现。如果皮疹较轻，可先观察；若皮疹严重或持续不缓解，需及时就医。过敏反应： 极个别情况下会出现严重过敏反应，如过敏性休克等，不过这种情况发生概率极低，约百万分之几。一旦出现面色苍白、呼吸困难、血压下降等过敏性休克表现，需立即抢救。一般来说，乙肝疫苗引起的不良反应大多较轻，能自行恢复。但如果不良反应持续不缓解或加重，应及时就医。