打黄体酮针可能会带来一些危害，比如部分人会出现头晕、头痛的情况，大约有10%左右的人在注射后会有这样的不适反应。
胃肠道方面的影响
恶心呕吐： 有些女性打黄体酮针后会出现恶心的症状，严重的可能会伴随呕吐，大概有5% - 8%的人会出现这种胃肠道不适。一般在注射后的短时间内比较明显，有的可能持续数小时。食欲变化： 可能会出现食欲改变，有的女性会变得食欲减退，进食量比平时减少；也有少数人会出现食欲亢进，总是感觉肚子饿。
注射部位的问题
局部疼痛： 打针的部位可能会有疼痛，大概有15%左右的人会感觉到注射部位有不同程度的疼痛，有的是轻微隐痛，有的可能比较明显，尤其是在注射后的当天较为明显。红肿硬结： 还有可能出现局部红肿、硬结，大约有3% - 6%的人会出现这种情况，红肿硬结的范围大小不一，小的可能只有几毫米，大的可能直径能达到1 - 2厘米左右，一般需要几天时间才能逐渐消退。
对内分泌的影响
月经周期紊乱： 长期或不规范使用黄体酮针可能会影响内分泌，导致月经周期紊乱，原本规律的月经可能会出现提前、推迟或者月经量异常等情况，大概有8% - 12%的人会因为打黄体酮针出现月经方面的改变。激素水平波动： 它会影响体内的激素水平平衡，可能会导致雌激素、孕激素等其他激素的水平出现波动，虽然一般在正常范围内波动，但也可能会引起一些相关的身体反应，比如情绪方面的变化等。