阴茎冠沟有小肉粒通常是由以下原因导致：
一、珍珠状阴茎丘疹：
1.这一般是由于生理发育上的变异而引起，主要表现为白色、肤色或淡红色丘疹。它既不属于肿瘤，也不属于性病。不过可能会有少数人出现瘙痒症状，且大多数发生在包皮过长的人群中。
2.针对珍珠状阴茎丘疹，遵医嘱可使用珍珠克等药物进行治疗。
二、尖锐湿疣：
1.通常是因感染了人类乳头瘤病毒（HPV病毒）而造成，属于性传播疾病。其表现为扁平状、菜花状、鸡冠样、蕈样等形状，会伴有异物感、灼痛、刺痒等症状。
2.对于尖锐湿疣，遵医嘱可使用咪喹莫特乳膏、氟尿嘧啶乳膏、三氯醋酸等药物进行治疗。
总之，阴茎冠沟有小肉粒一般可使用药物治疗，若情况严重，则需及时去医院就医，听从医生建议进行妥善处理。