女性支原体感染后症状表现多样。部分女性可能没有明显症状，而有症状的女性，泌尿生殖系统是主要受累部位，常见的如尿道炎表现为尿频、尿急、尿痛等，一般症状相对较轻，可能持续数天到数周不等。
泌尿生殖系统相关症状
尿道炎表现： 女性支原体感染引发尿道炎时，会出现尿道瘙痒感，有的还伴有不同程度的尿频，可能每1 - 2小时就有尿意，尿急表现为有尿意后需尽快排尿，尿痛则是排尿时尿道有灼热样疼痛。宫颈炎表现： 感染累及宫颈时，可能出现白带增多的情况，白带质地可能变得黏稠，颜色也可能有变化，如发黄等，还可能有外阴瘙痒症状。
其他系统可能出现的症状
呼吸系统感染相关症状： 如果支原体感染扩散到呼吸系统，女性可能出现咳嗽症状，多为干咳，有的咳嗽较为剧烈，可能影响睡眠和日常生活，还可能伴有发热，体温一般在37.5℃ - 38.5℃左右，有的女性还会感觉全身乏力。盆腔炎表现： 少数女性支原体感染严重时可能引发盆腔炎，会有下腹部疼痛，疼痛程度因人而异，有的是隐痛，有的较为剧烈，还可能出现月经紊乱，如月经周期延长或缩短、月经量增多或减少等情况。
无症状情况
有相当一部分女性支原体感染后没有明显的自觉症状，这类女性往往是在体检或因其他疾病检查时偶然发现支原体阳性。但即使没有症状，也可能具有传染性，需要引起重视。