发烧时全身酸痛主要是因为身体在感染等致热因素作用下，体内会产生如前列腺素等炎性介质，这些介质会刺激神经末梢，同时发烧引起的肌肉代谢加快，无氧酵解增多，产生乳酸堆积，从而导致全身酸痛。
感染性因素导致的全身酸痛
感染病原体（如病毒、细菌等）引发发烧时，免疫系统被激活，炎症反应产生的物质会作用于肌肉等组织，引起全身酸痛，这种情况常见于流感等病毒感染性疾病，病毒在体内繁殖过程中会引发一系列炎症反应累及全身肌肉。
非感染性因素导致的全身酸痛
一些非感染性疾病也可能引起发烧伴全身酸痛，如自身免疫性疾病等，自身免疫系统错误攻击自身组织，在这个过程中会伴随发烧，同时出现全身肌肉受累的酸痛表现。
儿童发烧全身酸痛需注意
儿童发烧时全身酸痛可能更需要关注，因为儿童表达能力有限。儿童发烧多由感染引起，如呼吸道感染等，需密切观察体温及全身状况，若持续全身酸痛且发烧不退，要及时就医，非药物干预可尝试适当减少衣物利于散热等，但要避免过度包裹。
老年人发烧全身酸痛要重视
老年人发烧伴全身酸痛时，由于身体机能衰退，潜在疾病风险更高。比如可能是肺炎等较为严重疾病引起，要留意老人的精神状态、体温变化等，及时就医检查，因为老年人对疾病的耐受能力差，需谨慎对待全身酸痛伴随发烧的情况。