新生婴儿黄疸照蓝光一般会有副作用，包括可能出现发热、腹泻、皮疹、刺激眼睛、刺激生殖器官等情况，需在正规医院进行治疗。
一、发热：婴儿黄疸照蓝光时可能引发发热症状，体温会有所波动。这是因为蓝光照射可能会使婴儿体温调节失衡。此时要及时补充液体，通常停止照蓝光后，发热症状可得到改善。
二、腹泻：部分婴儿还可能出现大便次数明显增多的现象。若不太严重，一般在停止蓝光后能逐渐缓解。这可能是蓝光对婴儿肠道功能产生了一定影响。
三、皮疹：由于婴儿年龄小，皮肤娇嫩，照蓝光可能会对皮肤造成刺激而出现皮疹。这是皮肤对蓝光刺激的一种反应。
四、刺激眼睛：蓝光光线较强，照蓝光时可能对眼睛产生一定刺激，所以必须要给婴儿佩戴眼罩，以避免眼睛受到伤害。
五、刺激生殖器官：照蓝光时也有可能对生殖器官造成一定损伤，因此要做好相应的保护措施，防止不良后果的发生。
总之，新生婴儿黄疸照蓝光若出现较为严重的副作用，需要及时配合医生进行治疗。