神经性勃起功能障碍可通过药物、物理及心理等多种方式治疗。一般来说，药物治疗是基础手段之一。
药物治疗选择
磷酸二酯酶5抑制剂： 如西地那非等，这类药物能通过抑制磷酸二酯酶5的活性，增加阴茎海绵体平滑肌松弛，促进血液流入，从而改善勃起功能。但使用时需注意，有心血管疾病的患者使用前要咨询医生，因为可能与一些心血管药物相互作用。前列地尔： 可以通过尿道内给药或阴茎海绵体内注射的方式使用，能扩张血管，增加阴茎血流，帮助勃起。不过尿道内给药可能会引起局部疼痛等不适，阴茎海绵体内注射需在医生指导下操作，避免自行盲目使用。
物理治疗方法
真空负压装置： 是一种非侵入性的物理治疗方式。通过负压吸引使血液积聚在阴茎，从而达到勃起的效果。使用时要注意时间不宜过长，一般每次10 - 30分钟，避免造成阴茎组织损伤。低能量体外冲击波治疗： 这种治疗方式可以刺激血管生成和组织修复，改善阴茎的血液循环，对神经性勃起功能障碍有一定的治疗作用。一般需要进行多个疗程的治疗，具体疗程数需根据患者情况由医生制定。
心理治疗干预
认知行为疗法： 通过改变患者对性相关的不良认知和行为模式来改善勃起功能。例如帮助患者消除焦虑、紧张等情绪对性功能的影响，让患者正确认识性健康问题。治疗师会根据患者的具体心理状态制定个性化的治疗方案，可能需要多次的心理辅导 sessions。夫妻共同治疗： 因为神经性勃起功能障碍可能会影响夫妻关系，夫妻共同参与治疗很重要。伴侣需要给予患者理解和支持，营造良好的性生活环境，通过沟通和互动来缓解患者的心理压力，促进勃起功能的改善。