灰指甲常用的有效药膏主要是抗真菌药膏，像阿莫罗芬搽剂就有一定效果，一般每周使用1 - 2次，连续使用数月可能见到效果。
阿莫罗芬搽剂：
作用机制： 它能抑制真菌细胞膜的合成，从而发挥抗真菌作用。可以渗透进入甲板，起到杀灭真菌的效果。使用注意： 使用前要先清洁病甲，然后涂抹在病甲上。不过它可能对甲周皮肤有一定刺激性，使用时需注意避开正常皮肤。
环吡酮胺乳膏：
作用原理： 环吡酮胺能改变真菌细胞膜的完整性，影响真菌细胞代谢过程。使用要点： 涂抹药膏时要确保覆盖病甲及周围皮肤，每天可使用1 - 2次。对于一些轻度的灰指甲，坚持使用有一定治疗作用，但对于较严重的情况，可能单独使用效果有限。
碘酊：
抗真菌特性： 碘酊有一定的抗真菌作用，它可以使菌体蛋白变性沉淀，从而杀灭真菌。使用方法： 使用时用棉签蘸取碘酊涂抹在病甲上，不过碘酊刺激性较强，可能会引起甲周皮肤疼痛、发红等情况，所以使用范围要尽量精准，避免大面积涂抹刺激正常皮肤。而且碘酊染色比较明显，可能会影响外观。
尿素软膏：
辅助作用： 在治疗灰指甲时，有时会先用尿素软膏软化病甲。因为灰指甲的病甲较厚，先用尿素软膏可以使病甲软化，方便后续使用抗真菌药膏更好地渗透。一般每天涂抹尿素软膏1 - 2次，持续数天，待病甲软化后再进行抗真菌治疗。但使用尿素软膏时要注意，不能让软膏接触到正常皮肤太多，以免引起皮肤刺激。