怀孕进行孕检时，可能出现孕囊偏小但有胎心胎芽的情况，尤其在怀孕六周时。对此可采取如下方式处理：
一、观察：若女性月经周期较长，排卵会推迟，受孕时间相对晚，即便按月经周期推算为怀孕六周，实际受精卵着床晚，会导致孕囊发育晚而偏小，有胎心胎芽。这通常是正常情况，建议1周后、2周后复查超声，查看胎儿是否持续发育。
二、加强营养：怀孕初期若孕吐严重，机体营养物质供给不足，可能使孕囊偏小但有胎心胎芽。可通过加强营养促进孕囊发育，多吃蛋白质丰富的食物，如鸡蛋、牛奶、牛肉等，但要注意膳食均衡，避免偏食影响孕囊正常发育。
三、药物治疗：怀孕六周时若孕酮偏低，可能影响孕囊正常发育，此时需配合医生及时补充孕酮，可口服黄体酮胶囊或使用黄体酮注射液，孕酮补充后孕囊可正常发育。
四、手术治疗：若胚胎本身存在先天染色体发育异常，也可能出现怀孕六周孕囊偏小，此时虽有胎心胎芽，但后续可能出现胎停。建议完善唐氏筛查以及无创DNA检查以明确是否存在染色体异常，若有则需及时终止妊娠。
总之，怀孕六周出现孕囊偏小有胎心胎芽的情况时，要根据具体情况选择合适的处理方式，密切关注胎儿发育情况。