龟头炎的治疗需根据不同病因选择合适方法，一般来说，局部治疗为主，若是细菌感染引起的龟头炎，可使用莫匹罗星软膏等外用抗生素，这类药物通常能在数天内改善症状。
局部治疗方式
清洁护理： 每天用清水清洗龟头部位，保持局部清洁干燥，避免污垢残留加重炎症。清洗时要轻柔，防止损伤皮肤。外用药物： 对于念珠菌性龟头炎，可外用克霉唑乳膏等抗真菌药物；若是细菌性龟头炎，常用莫匹罗星软膏等抗生素软膏。使用外用药物时，要先清洁龟头后再涂抹，保证药物能充分接触患处。
全身治疗情况
抗生素应用： 如果龟头炎是由细菌感染且病情较重时，可能需要口服抗生素，如头孢类抗生素等，但具体用药需遵医嘱，因为不同的细菌感染可能需要不同的抗生素，且要注意可能的过敏等情况。抗真菌药物： 若龟头炎是由真菌感染引起，且外用药物效果不佳时，可能会口服抗真菌药物，如氟康唑等，但需注意药物的不良反应及与其他药物的相互作用。
特殊情况处理
包皮过长或包茎导致的龟头炎： 急性炎症控制后，对于包皮过长或包茎反复引起龟头炎的患者，一般建议在炎症消退后行包皮环切术，这样可以从根源上解决龟头炎反复发作的问题。比如，青少年患者若存在包皮过长反复引发龟头炎，在合适的时机进行手术是较好的选择。糖尿病患者的龟头炎： 糖尿病患者容易并发龟头炎，且病情可能较难控制，这类患者除了针对龟头炎进行治疗外，还需要积极控制血糖，将血糖控制在合理范围内，才能更好地治疗龟头炎并防止其复发。例如，血糖应控制在空腹血糖7mmol/L以下，餐后血糖10mmol/L以下等合适范围。