扁桃体炎是腭扁桃体的非特异性炎症，咽喉炎是咽部黏膜、黏膜下组织的炎症，两者在发病部位、症状表现等方面有差异。
发病部位差异
扁桃体炎主要累及扁桃体，扁桃体位于口咽部两侧；咽喉炎发病部位为咽部，包括鼻咽、口咽和喉咽等区域。
症状表现区别
扁桃体炎患者多有扁桃体红肿、疼痛，严重时可出现扁桃体表面有脓性分泌物，还可能伴有发热、畏寒等全身症状；咽喉炎患者主要表现为咽部干燥、灼热、疼痛、吞咽不适等，全身症状相对较轻。
病因方面不同
扁桃体炎多由乙型溶血性链球菌等细菌感染引起，也可由病毒感染导致；咽喉炎的病因有病毒、细菌感染，还与环境因素（如空气污染、粉尘等）、用声过度、过敏等有关。
诊断方式有别
医生通过检查咽部，观察扁桃体及咽部黏膜的情况来诊断，扁桃体炎可见扁桃体明显异常，咽喉炎主要是咽部黏膜的改变。对于儿童患者，由于其免疫力相对较低，更易患扁桃体炎或咽喉炎，要注意观察孩子的症状变化，如有异常及时就医。在生活中，要保持良好的生活方式，如均衡饮食、适量运动等，以降低患病风险。