阴茎疼可能由多种原因引起。比如外伤是常见原因之一，像性生活中过于激烈、外力撞击等都可能导致阴茎局部受伤而疼痛，这种情况有时可能在受伤后立刻出现明显痛感。
炎症因素导致的阴茎疼
包皮龟头炎： 如果存在包皮过长或不注意个人卫生，就容易引发包皮龟头炎，此时阴茎头和包皮部位会出现红肿、疼痛，还可能伴有瘙痒、分泌物增多等症状。例如一些男性不经常清洗下体，就增加了患包皮龟头炎导致阴茎疼的风险。尿道炎： 尿道炎也可能牵连导致阴茎疼，特别是淋菌性尿道炎或非淋菌性尿道炎，除了尿道有尿频、尿急、尿痛等症状外，有时也会放射到阴茎部位引起疼痛。
感染性因素造成的阴茎疼
病毒感染： 像单纯疱疹病毒感染，可能会在阴茎部位出现水疱，随后破溃形成溃疡，伴有疼痛。这种病毒感染具有一定传染性，可通过性接触传播等。细菌感染： 当阴茎受到细菌侵袭时，也会引发疼痛，比如常见的大肠杆菌等感染，会导致阴茎局部炎症反应，出现疼痛、红肿等表现。
其他因素引发的阴茎疼
结石问题： 虽然相对少见，但尿道结石也可能导致阴茎疼，结石会刺激尿道黏膜，引起疼痛，同时可能伴有排尿困难等症状。阴茎硬结症： 患者阴茎海绵体白膜会出现纤维化硬结，在勃起时可能会引起疼痛，并且阴茎可能会出现弯曲畸形等情况，多发生于中年男性。