胚胎停育指妊娠早期胚胎因某种原因导致发育停止。据统计，在所有临床确认的妊娠中，约15%~20%会发生胚胎停育。
染色体因素：
胚胎自身染色体异常：约50%~60%的胚胎停育是由于胚胎自身染色体数目或结构异常引起的。比如常见的三体综合征，如13-三体、18-三体、21-三体等，这些异常会导致胚胎无法正常发育。父母染色体异常：若父母双方有一方染色体存在平衡易位、倒位等结构异常，也可能遗传给胚胎，从而引发胚胎停育。例如父亲或母亲携带平衡易位染色体，就有可能传递给子代，影响胚胎正常发育进程。
母体因素：
内分泌失调：女性体内的激素水平对胚胎发育至关重要。如黄体功能不全，会使得孕激素分泌不足，无法为胚胎着床和发育提供良好的内分泌环境，约有30%的胚胎停育与黄体功能不全有关；甲状腺功能异常，无论是甲状腺功能亢进还是减退，都可能影响胚胎的生长发育，甲状腺激素水平异常会干扰胚胎的代谢等一系列过程。全身性疾病：孕妇患有严重的全身性疾病，像糖尿病未控制好时，高血糖环境会影响胚胎的发育；严重的高血压会导致胎盘供血不足，进而影响胚胎营养供应，使得胚胎无法正常生长而停育。
子宫因素：
子宫解剖异常：子宫畸形，如纵隔子宫、双角子宫等，会影响子宫腔的形态，使得胚胎着床位置异常或发育空间受限；子宫肌瘤，尤其是黏膜下子宫肌瘤，会影响宫腔内环境，阻碍胚胎的正常发育，较大的子宫肌瘤还可能压迫胚胎周围组织，影响血供。子宫内膜病变：子宫内膜过薄或过厚都不利于胚胎着床。子宫内膜炎会破坏子宫内膜的正常结构和功能，影响胚胎的种植和发育。
免疫因素：
自身免疫异常：孕妇体内存在抗磷脂抗体等自身抗体时，会影响胎盘的血管形成，导致胎盘血流灌注不足，使胚胎缺乏营养供应而停育。例如抗磷脂抗体综合征患者，其体内的自身抗体可导致胎盘血管血栓形成，影响胎儿的血液供应。同种免疫异常：孕妇对胚胎的免疫耐受不足，母体免疫系统将胚胎视为“异物”进行攻击，从而导致胚胎停育。比如自然杀伤细胞活性过高等情况，会对胚胎造成损伤。