三叉神经痛是一种常见的脑神经疾病，其发病原因较为复杂。目前认为主要与以下几方面因素有关。首先是血管压迫，约有90%左右的原发性三叉神经痛是由于颅内血管，如小脑上动脉、小脑前下动脉等压迫三叉神经根部所致。
血管因素导致
血管压迫机制： 颅内的血管长期搏动性压迫三叉神经，会使神经纤维的髓鞘发生变性，从而导致神经冲动发生短路，使得三叉神经分布区域出现剧烈疼痛。这种血管压迫在中老年人中相对较为常见，随着年龄增长，血管发生迂曲、硬化等改变，压迫神经的几率增加。
神经脱髓鞘改变
脱髓鞘的影响： 三叉神经感觉根或半月节部位发生脱髓鞘改变时，相邻的轴突之间的神经冲动发生“短路”，轻微的触觉刺激即可通过“短路”传入中枢，而中枢的传出冲动也可通过“短路”成为传入冲动，如此反复，就会引起三叉神经分布区域的疼痛发作。例如，一些脑部炎症、外伤等因素可能会诱发神经脱髓鞘。
其他少见因素
肿瘤压迫： 如颅底肿瘤、桥小脑角肿瘤等，可能会压迫三叉神经，导致三叉神经痛。不过这种情况相对较少见，约占三叉神经痛病因的1%左右。另外，多发性硬化等脱髓鞘性疾病也可能累及三叉神经，引发疼痛症状。还有研究发现，遗传因素也可能在三叉神经痛的发病中起到一定作用，但具体机制尚不完全明确。