柯萨奇病毒感染可引起多种健康问题。柯萨奇病毒感染后，最常见的是引起呼吸道感染，约有30%左右的上呼吸道感染是由柯萨奇病毒导致的；还可能引发手足口病，多见于儿童，尤其是5岁以下儿童易受感染。
引起的呼吸道相关问题
上呼吸道感染： 感染柯萨奇病毒后，患者会出现发热症状，体温可达到38℃~39℃左右，同时伴有咳嗽、流涕等症状，类似于普通感冒表现，但由柯萨奇病毒引起的上感可能全身症状相对更明显些，如乏力等。病毒性咽炎： 患者咽部会有明显的充血、水肿，伴有疼痛，吞咽时疼痛可能会加重，部分患者还可能出现咽部有疱疹的情况。
引起的手足口病表现
手部症状： 患儿的手掌、手指部位会出现皮疹，初期为红色斑丘疹，随后可发展为疱疹，疱疹周围有炎性红晕，疱内液体较少，一般没有明显瘙痒。足部症状： 足部，包括足底、足侧缘等部位也会出现类似手部的皮疹和疱疹，影响患儿行走。口腔症状： 口腔内的颊黏膜、舌、硬腭等部位会出现散在的疱疹或溃疡，疼痛明显，患儿会出现拒食、流涎等表现。
引起的其他相关问题
病毒性心肌炎： 少数情况下，柯萨奇病毒感染可能累及心脏，引发病毒性心肌炎，患者会出现心悸、胸闷、气短等症状，严重时可能会影响心脏功能，导致心律失常等情况。不过这种情况相对较少见，但一旦发生需要引起重视。脑膜炎或脑炎： 个别患者感染柯萨奇病毒后可能会引发脑膜炎或脑炎，患儿会出现头痛、呕吐、嗜睡甚至惊厥等症状，病情严重程度不一，需要及时就医进行诊治。