妊娠期甲状腺功能亢进有以下两种治疗方式：
一、药物治疗是首选，即通过丙硫氧嘧啶、甲巯咪唑这两种药物来进行治疗。这是较为常用的治疗手段。丙硫氧嘧啶适用于各种类型的甲状腺功能亢进症，尤其适用于病情较轻、甲状腺轻至中度肿大的患者，以及青少年、儿童、老年患者等。甲巯咪唑则对甲状腺功能亢进也有较好的疗效。
二、若经过药物治疗后发现无效，在妊娠中期以后，可以考虑实施甲状腺的部分切除术。但要注意，在妊娠期若发现甲状腺功能亢进，是绝对禁止使用碘131来进行诊断和治疗的，因为碘131可能会对胎儿造成不良影响。
总之，对于妊娠期甲状腺功能亢进的治疗，需要根据具体情况选择合适的方法，同时要密切关注孕妇和胎儿的健康状况。