肛瘘通常需要手术治疗，目前常用的手术方式有肛瘘切开术、肛瘘挂线术等，一般经过规范手术治疗，大部分患者可治愈。手术费用因地区、医院等级等因素有所不同，大概在几千元到上万元不等。
手术治疗方式
肛瘘切开术：适用于低位肛瘘。手术是将瘘管全部切开，靠肉芽组织生长使伤口愈合。这种手术相对直接，但术后伤口恢复需要一定时间，一般需要几周。肛瘘挂线术：多用于高位肛瘘。利用橡皮筋或有腐蚀作用的药线的机械性压迫作用，缓慢切开肛瘘。挂线过程中患者痛苦相对较小，且能较好地保护肛门括约肌功能，术后一般10 - 14天挂线会脱落。
术后护理要点
伤口清洁：术后要保持肛门局部清洁，每次排便后最好用温水清洗肛门，可遵医嘱用高锰酸钾溶液坐浴，一般每天1 - 2次，每次15 - 20分钟，这样能防止伤口感染，促进愈合。饮食注意：术后应多吃富含膳食纤维的食物，如蔬菜（芹菜、菠菜等）、水果（香蕉、苹果等），保持大便通畅，避免便秘，因为便秘会增加伤口疼痛和出血的风险；同时要避免吃辛辣、刺激性食物，如辣椒、花椒等，这些食物可能刺激伤口，影响恢复。
非手术治疗情况
适用人群：对于一些特殊情况不能马上手术的患者，如身体状况较差、伴有严重基础疾病等，可采用非手术治疗暂时缓解症状。非手术治疗主要是使用抗生素控制感染，可根据病情选用合适的抗生素，如头孢类抗生素等，但非手术治疗很难彻底治愈肛瘘，只是暂时控制炎症。注意事项：非手术治疗期间要密切观察病情变化，如果症状没有改善甚至加重，如疼痛加剧、流脓增多等，应及时转为手术治疗。