慢性萎缩性胃炎的治疗药物需根据具体情况选择，一般常用药物有抑酸剂、胃黏膜保护剂等。例如，质子泵抑制剂是常用的抑酸剂，像奥美拉唑，能有效抑制胃酸分泌，缓解因胃酸过多引起的不适，其价格因不同厂家和规格有所差异，大致在几元到几十元不等。
抑酸剂类药物
质子泵抑制剂：这类药物能强力抑制胃酸分泌，常见的有奥美拉唑、兰索拉唑等。它们通过特异性地作用于胃黏膜壁细胞，抑制胃酸分泌的最后步骤，从而减轻胃酸对胃黏膜的刺激，一般可缓解慢性萎缩性胃炎患者因胃酸过多导致的胃痛、反酸等症状。H₂受体拮抗剂：如雷尼替丁、法莫替丁等，也是常用的抑酸药物。它能竞争性阻断组胺H₂受体，减少胃酸分泌，作用相对质子泵抑制剂稍弱，但也能在一定程度上改善患者的症状。
胃黏膜保护剂类药物
铋剂：像枸橼酸铋钾，它可以在胃黏膜表面形成一层保护膜，隔离胃酸、胃蛋白酶及有害物质对胃黏膜的侵袭，还能促进胃黏膜的修复和再生，有助于慢性萎缩性胃炎患者胃黏膜的恢复。铝碳酸镁：该药物能迅速中和胃酸，并吸附胃蛋白酶等物质，同时还可以结合胆汁酸，对胃黏膜起到保护作用，缓解患者的胃痛、胃胀等不适症状。
改善胃动力类药物
多潘立酮：如果慢性萎缩性胃炎患者伴有消化不良、腹胀等胃动力不足的情况，多潘立酮可以促进胃肠蠕动，加快胃排空，从而改善患者的消化功能，缓解腹胀等症状。莫沙必利：也是一种促进胃动力的药物，它可以刺激胃肠道胆碱能中间神经元及肌间神经丛的5 - HT₄受体，促进乙酰胆碱的释放，增强胃肠道蠕动，改善患者的消化功能状态。