婴儿枕秃多是由多种因素引起的，其中较为常见的原因之一是头部与枕头频繁摩擦。婴儿大部分时间是躺着的，头部不断与枕头接触，尤其是在夏季，婴儿出汗较多时，头部皮肤会因为出汗发痒，婴儿会通过左右摇头来缓解不适，长时间摩擦就容易导致枕秃，这种情况在婴儿中较为普遍，大约有60%以上的婴儿会出现不同程度的枕秃现象。
生理因素导致的枕秃
新陈代谢旺盛：婴儿新陈代谢比成人快很多，头部出汗较多，尤其是入睡后1-2小时内，头部会大量出汗，汗液会刺激头皮，让婴儿感觉不舒服，从而通过摇头来摩擦枕头，时间长了就会出现枕秃。一般3岁以内的婴儿新陈代谢都相对较快，这是导致枕秃的常见生理原因。头部容易摩擦：婴儿的头部相对较大且较重，颈部肌肉还未发育完善，头部的稳定性较差，在躺着的时候头部会不断转动，与枕头之间的摩擦就比较频繁，特别是一些较硬的枕头，更容易造成枕秃。
营养因素相关的枕秃
维生素D缺乏：如果婴儿体内缺乏维生素D，会影响钙的吸收，导致神经兴奋性增高，婴儿会出现多汗、夜惊、烦躁不安等症状，多汗会导致婴儿头部瘙痒，进而频繁摇头摩擦枕头，引起枕秃。一般母乳喂养的婴儿在出生后2周左右就需要开始补充维生素D，每天补充400国际单位，如果没有及时补充，就容易出现维生素D缺乏的情况。钙摄入不足：虽然维生素D缺乏会影响钙的吸收，但如果婴儿钙摄入本身不足，也会引发一系列症状，其中就包括多汗和枕秃。1岁以内的婴儿每天需要摄入300-400毫克的钙，通过母乳或配方奶可以获取一部分钙，但如果婴儿的奶量不足或者饮食中钙含量不够，就可能导致钙摄入不足。
疾病因素引发的枕秃
湿疹：婴儿如果患有湿疹，尤其是发生在头部的湿疹，会让头皮瘙痒难忍，婴儿会通过摇头来蹭痒，这样就会导致枕秃。婴儿湿疹多在出生后1-3个月发病，头部是常见的发病部位之一，表现为头皮上有红斑、丘疹、水疱等，伴有剧烈瘙痒。脂溢性皮炎：头部患有脂溢性皮炎的婴儿，头皮会有油腻性的鳞屑，并且伴有瘙痒感，婴儿也会因为瘙痒而频繁摇头摩擦枕头，从而出现枕秃。脂溢性皮炎在婴儿期也比较常见，可能与母体雄激素通过胎盘传给胎儿，导致新生儿皮脂腺分泌旺盛有关。