包皮术后第三天出现有点水肿，主要可能由以下原因导致：
一、术后正常现象。在包皮术后，患者相关部位的血管、淋巴管被切断，这就会引发血液回流出现异常状况，进而引起水肿。不过这种情况持续时间通常不会太久，一般在过几天后，患者体内新的回流通路便会再次构建成功，如此一来水肿现象就会逐渐消失。
二、操作不当。也有可能是因为医生在操作时存在不当之处，比如导致包皮留得比较长、包皮口的狭窄问题没有得到妥善解决。倘若水肿较为严重，同时包皮留得很长，并且还有狭窄环存在，那么可能还需要进行二次手术。
三、继发感染。水肿还有可能是由于患者在手术过程中或者术后没有做好相应的护理工作，使得该部位产生了继发感染。对此，患者可以遵循医嘱服用阿莫西林、氧氟沙星等来进行抗感染的治疗。
总之，包皮术后第三天水肿可能是正常的术后反应，也可能是操作问题或感染导致，需要根据具体情况进行分析和处理。