皮脂腺囊肿主要的治疗办法是手术切除。一般来说，手术切除是根治皮脂腺囊肿的有效方式，通常在门诊就可进行，手术时间较短，大概30分钟左右就能完成。
手术治疗是主要方式
手术切除步骤： 医生会先对囊肿部位进行消毒，然后局部麻醉，接着做一个小切口，将囊肿完整摘除。如果囊肿并发感染，需要先控制炎症，再安排手术。术后注意事项： 术后要保持伤口清洁干燥，避免沾水，防止感染。一般7天左右拆线。
小的无症状囊肿可观察
观察的情况： 对于那些体积较小、没有任何不适症状的皮脂腺囊肿，可以先进行观察。但要注意不要经常用手去挤压囊肿，因为挤压可能会导致囊肿感染或者炎症加重。观察中的留意点： 在观察过程中，要留意囊肿的大小、质地以及是否有红肿、疼痛等变化，如果出现异常变化要及时就医。
囊肿感染时的处理
感染后的初步处理： 当皮脂腺囊肿出现感染，表现为红肿、疼痛甚至有脓液时，首先可以局部涂抹抗生素软膏，像莫匹罗星软膏等，来控制炎症。同时要保持局部清洁，避免挤压。感染严重时的处理： 如果感染比较严重，出现发热等全身症状，可能需要口服抗生素，如头孢类抗生素（不过具体用药要遵医嘱），必要时可能需要切开引流，将脓液排出，待炎症控制后再考虑进一步的手术切除。