甲状腺炎的治疗需根据不同类型来定。比如亚急性甲状腺炎，一般约1/3的患者会在数周或数月内自行缓解，但也有部分患者可能需要药物缓解症状。
亚急性甲状腺炎的治疗
对症止痛治疗： 如果患者有疼痛症状，可使用非甾体抗炎药，像阿司匹林等，能缓解疼痛和发热。不过要注意，儿童和孕妇使用这类药物需谨慎，得在医生指导下用。甲状腺功能异常的处理： 若出现甲状腺功能亢进，一般是暂时性的，通常不需要抗甲状腺药物治疗，症状明显时可适当使用β受体阻滞剂，如普萘洛尔，但要密切监测甲状腺功能变化。如果出现甲状腺功能减退且症状明显，可短期适量使用左甲状腺素替代治疗。
自身免疫性甲状腺炎的治疗
桥本甲状腺炎： 如果甲状腺功能正常，通常不需要特殊治疗，但要定期复查甲状腺功能和甲状腺超声，一般建议每6 - 12个月复查一次。当出现甲状腺功能减退时，需要使用左甲状腺素替代治疗，治疗目标是将促甲状腺激素（TSH）维持在正常范围内，起始剂量要根据患者年龄、体重等因素来定，比如年轻、体重正常的患者起始剂量可能从25 - 50μg/天开始，然后根据TSH水平调整剂量。萎缩性甲状腺炎： 治疗原则与桥本甲状腺炎类似，主要也是根据甲状腺功能状态进行相应处理，甲状腺功能正常时定期监测，甲状腺功能减退时给予左甲状腺素替代。
感染性甲状腺炎的治疗
细菌感染引起的甲状腺炎： 主要是使用抗生素治疗，要根据细菌培养和药敏试验结果选择敏感的抗生素。一般需要足疗程用药，比如通常需要连续使用抗生素2周左右，但具体时间要根据病情严重程度和治疗反应来调整。病毒感染引起的甲状腺炎： 如病毒性甲状腺炎，主要是对症支持治疗，同时密切观察病情变化，病毒感染有自限性，大部分患者经过对症处理后可逐渐恢复。