扁桃体发炎时，常用的药物有抗生素类等。一般细菌感染引起的扁桃体发炎，可选用青霉素类抗生素，如阿莫西林等，通常用药后几天内症状会有所缓解，但具体起效时间因个体差异和病情严重程度不同。
抗生素类药物
青霉素类： 像阿莫西林，它对大多数引起扁桃体发炎的链球菌等有较好的抗菌作用。不过对青霉素过敏的人不能用。头孢菌素类： 例如头孢拉定等，也是针对细菌感染导致的扁桃体发炎，能抑制细菌细胞壁的合成来发挥杀菌作用。但同样要注意过敏情况，有头孢类药物过敏史的人禁用。
对症治疗药物
解热镇痛药： 如果扁桃体发炎伴有发热、咽痛较明显的情况，可以使用对乙酰氨基酚。一般成人每次服用0.5克左右，能起到退热、缓解疼痛的作用，但要注意不能超量服用，且有严重肝肾功能不全的人需谨慎使用。儿童要根据年龄和体重调整剂量，比如12岁以下儿童需在医生指导下按体重服用合适剂量。糖皮质激素： 对于病情比较严重，有高热不退等情况的患者，可能会短期使用糖皮质激素，如地塞米松等。但这类药物有一定的副作用，需要严格掌握适应证和剂量，一般是在其他治疗效果不佳时才考虑使用，并且要密切观察用药后的反应。
局部用药
含漱液： 可以使用复方硼砂含漱液，它能清洁口腔、杀菌消炎，每次含漱几分钟，一天可以用几次，有助于减轻扁桃体发炎引起的咽部不适等症状。不过含漱时要注意方法，保证药物能充分接触咽部。含片： 比如度米芬含片，含服后能直接作用于咽部局部，起到杀菌、消肿止痛的效果，缓解扁桃体发炎带来的咽痛等不适，但要按照说明书的要求含服，不能过量。需要注意的是，用药前一定要先明确扁桃体发炎是细菌感染还是病毒感染等情况。如果是病毒感染引起的扁桃体发炎，使用抗生素是无效的。而且用药要在医生的指导下进行，不能自己随意买药服用，特别是一些特殊人群，如孕妇、儿童、老年人等，用药更要谨慎，避免出现不良反应。