功能性子宫出血的治疗需根据具体情况选择，一般可通过药物治疗、手术治疗等方式。药物治疗中，常用的有孕激素，如黄体酮，能使子宫内膜转化为分泌期，从而止血。一般来说，规范治疗下多数患者能得到有效控制。
药物治疗方法
孕激素类药物：像黄体酮，可让子宫内膜由增生期转为分泌期，之后停药会发生撤退性出血，类似一次月经，适用于血红蛋白大于60g/L的患者。还有甲地孕酮，也能起到使子宫内膜转化的作用来止血。雌激素类药物：苯甲酸雌二醇可用于青春期功能性子宫出血，能迅速修复子宫内膜创面达到止血目的，但有一定不良反应，需在医生严密监测下使用。
手术治疗方式
刮宫术：适用于已婚患者，既能迅速止血，又能明确子宫内膜病变情况。对于年龄大于40岁、药物治疗无效或存在子宫内膜病理改变的患者较为适用。子宫内膜去除术：适用于药物治疗无效的顽固性功能性子宫出血且无生育要求的患者。通过破坏子宫内膜来减少出血。子宫切除术：适用于年龄较大、无生育需求且药物治疗无效、病变严重的患者，但这是最后选择的治疗方式。
一般治疗要点
纠正贫血：功能性子宫出血可能导致贫血，若血红蛋白低于80g/L，可通过补充铁剂，如硫酸亚铁，同时摄入富含铁的食物，像红肉、豆类等，来纠正贫血状况。注意休息：患者要保证充足的休息，避免过度劳累，过度劳累可能会加重出血情况。避免剧烈运动，让身体有较好的恢复环境。