熬夜可能会引发多种健康问题。长期熬夜的人患心血管疾病的风险会增加，有研究表明，长期睡眠不足的人群中，高血压的发生率比作息规律人群高出约30%。
对免疫系统的影响
免疫力下降： 长期熬夜会干扰免疫系统的正常功能，使身体抵御病原体的能力减弱。例如，正常成年人每天需要保证7 - 8小时的高质量睡眠，而长期熬夜的人，其体内负责免疫的T淋巴细胞活性会降低，导致身体更容易受到细菌、病毒等的侵袭，感冒等疾病的发病几率会明显升高。炎症反应异常： 熬夜还会促使体内炎症因子分泌增加，引发慢性炎症状态。长期处于这种状态下，会增加患关节炎等慢性炎症性疾病的风险。
对神经系统的影响
记忆力减退： 大脑需要充足的睡眠来进行记忆巩固。每晚睡眠不足6小时的人，连续一周后，其记忆力测试成绩会比睡眠充足时下降约10% - 15%。熬夜会影响大脑中与记忆相关的海马体区域的功能，导致新信息难以有效存储，旧记忆也容易模糊。情绪调节紊乱： 睡眠与大脑中的神经递质平衡密切相关。长期熬夜会打乱神经递质如血清素、多巴胺等的分泌节律，容易引发焦虑、抑郁等情绪问题。据统计，长期熬夜人群中，抑郁症的发病率比作息正常人群高出约2倍。
对内分泌系统的影响
激素分泌失调： 熬夜会干扰内分泌激素的分泌。例如，生长激素主要在夜间深度睡眠时分泌，青少年长期熬夜会影响生长激素的正常分泌，从而影响身高发育；对于成年人，熬夜会导致胰岛素分泌异常，增加患糖尿病的风险，有研究发现，长期熬夜人群患2型糖尿病的风险比规律作息人群高约40%。皮肤问题增多： 皮肤的新陈代谢也依赖于良好的睡眠。熬夜会使皮肤的油脂分泌失衡，容易出现痤疮、粉刺等皮肤问题，同时还会导致皮肤暗沉、粗糙，因为睡眠不足会影响皮肤的血液循环和胶原蛋白合成，加速皮肤衰老，正常成年人每晚应保证7小时以上睡眠来维持皮肤的良好状态，而熬夜人群皮肤老化速度会比作息正常人群快约1.5倍。