毛囊萎缩脱发的治疗需依据脱发时间、面积来决定，包含药物及植发等方式。具体如下：
一、脱发具体情况：
1.若毛囊萎缩脱发是由毛囊炎导致，且毛囊已萎缩坏死，那么已脱发区域无法再长出头发。
2.对于处于脱发期的患者，应做到“早发现、早诊断、早治疗”，以阻止脱发进一步扩大。
二、脱发面积：
1.若脱发面积较小，不超过1厘米左右，可外用药物进行治疗。
2.若脱发面积较大，且毛囊炎症严重，除涂抹外用药物外，还应配合口服抗生素进行治疗。若药物等方法治疗无效，则可考虑植发。
患者日常要注意保持头皮清洁，拥有良好心态，积极配合医嘱进行治疗，应在医师指导下确定治疗方案，切不可自行盲目用药。
总结：毛囊萎缩脱发的治疗要综合考虑多方面因素，患者需遵循专业建议进行合理治疗和日常护理。