月经后两天同房不一定会怀孕，这取决于月经期持续时间以及同房时间与月经第一天的距离。可通过观察下次月经是否来潮、验孕棒检测、血液HCG水平检测等来确认。女性月经周期从一次月经来潮开始到下一次月经来潮结束，通常为28至30天左右。正常排卵时间在月经周期中间段，因精子能存活两三天，卵子排出后半天到一天内有受精能力，所以月经周期中间的14日左右较易受孕。对于月经周期规律的育龄期女性：
一、若同房时间在月经周期的前8天左右，即从月经第一天开始算的8天内，则同房后一般不易受孕；
1.如果月经持续时间较短，结束后两天还处于相对安全的时间段；
(1)此时受孕概率较低。
2.如果月经持续时间较长，结束后两天可能就超出了安全时间段；
(1)那么受孕的可能性会增加。
二、若月经持续时间较长，结束后再过两天基本就到了月经周期的8天以后，则同房后比较容易受孕。
总之，要准确判断月经后两天同房是否会怀孕，需要综合多方面因素来考虑。