支原体衣原体检查阳性时，需依据不同病源类型选用不同治疗药物，且要治疗后复查确保痊愈。具体如下：
一、要到医院接受正确治疗。如果是肺炎引起的支原体衣原体阳性，可服用四环素、阿奇霉素等药物治疗；若是沙眼类的支原体衣原体阳性，则需用青霉素或利福平进行治疗。
1.四环素：属于广谱抗生素，对支原体衣原体有抑制作用。
2.阿奇霉素：能有效对抗支原体衣原体感染。
3.青霉素：对沙眼类支原体衣原体有效。
4.利福平：可用于治疗相应感染。
二、若药物治疗效果不佳可采用手术治疗，一般采用挤压术改善支原体衣原体感染情况。
三、除正规治疗外，还要保证居住环境整洁、空气流通，尽量避免熬夜，保持充足睡眠，多吃含蛋白质矿物质食物，以起到辅助治疗作用。
总之，支原体衣原体阳性后要采取多种措施，包括正确治疗、改善环境和生活习惯等，以促进康复。