屁股沟疼痛可能由多种原因引起，比如常见的肛周皮肤疾病，像股癣，它是由真菌感染导致的，大约有20% - 30%的人可能会因为皮肤潮湿等因素感染股癣而出现屁股沟疼痛；还有湿疹，长时间处于潮湿环境或者接触过敏原等都可能引发，发病率在人群中能达到10%左右。
皮肤疾病相关
股癣：由皮肤癣菌感染引起，多发生在腹股沟、会阴、肛周等部位，会出现红斑、丘疹、水疱等皮损，伴有瘙痒和疼痛。一般需要保持局部干燥清洁，可外用抗真菌药物，如咪康唑乳膏等。湿疹：是一种慢性炎症性瘙痒性皮肤病，屁股沟部位的湿疹可能与局部潮湿、摩擦、过敏等有关，表现为皮肤红斑、渗液、结痂、瘙痒疼痛等。要避免搔抓刺激，可外用糖皮质激素药膏，如氢化可的松乳膏等。
肛肠疾病相关
肛裂：如果大便干结，排便时过度用力，可能会导致屁股沟处的肛管皮肤裂开，引起疼痛，尤其在排便时和排便后疼痛明显，部分患者还会伴有便血，发病率在肛肠疾病中占一定比例。需要调整饮食，多吃膳食纤维丰富的食物，保持大便通畅，可外用硝酸甘油软膏等缓解症状。痔疮：内痔脱出嵌顿或者外痔发炎时，也可能导致屁股沟疼痛。内痔脱出嵌顿会有肿物脱出不能回纳，伴有疼痛；外痔发炎则表现为屁股沟处肿物疼痛、肿胀。轻度痔疮可通过坐浴等保守治疗，如用1:5000高锰酸钾溶液坐浴，严重时可能需要手术治疗。
感染性疾病相关
肛周脓肿：是肛管直肠周围软组织或其周围间隙发生的急性化脓性感染，常表现为屁股沟处红肿、疼痛，且疼痛逐渐加重，可伴有发热等全身症状。一旦确诊，多需要手术切开引流，早期治疗很关键，若不及时处理可能会向深部蔓延。毛囊炎：屁股沟处的毛囊受到细菌感染引发毛囊炎，会出现以毛囊为中心的红色丘疹，伴有疼痛，严重时可形成脓疱。要注意局部清洁，可外用抗生素药膏，如莫匹罗星软膏等。