孕酮低通常不会导致胎儿畸形，但易引发流产。
一、孕酮是卵巢黄体分泌的天然孕激素，在怀孕过程中有重要作用：
1.可刺激子宫变化；
2.通过增加生殖系统血管和组织的血流来促进胚胎发育。
二、怀孕期间孕酮低的影响：
1.可能导致胎儿发育迟缓；
2.使子宫敏感，外界稍刺激就可能引发宫缩，进而导致流产。
三、孕酮低通常与胎儿畸形无关，胎儿畸形主要与以下因素有关：
1.染色体异常；
2.基因异常；
3.感染；
4.辐射。
四、预防胎儿畸形的措施：孕期做好相关检查，包括：
1.对胎儿染色体异常的筛查；
2.针对胎儿畸形筛查的超声检查，其中21-三体综合征等染色体异常为重点。
总之，孕酮低主要与流产相关，而胎儿畸形有其特定的多种成因，孕期应重视相关检查以预防胎儿畸形。