甲状腺结节囊肿的严重程度取决于结节性质、大小以及囊肿性质与压迫程度。一、较小甲状腺结节（8mm以内）：通常是良性，不会导致甲状腺功能障碍及其他明显临床症状，不算严重，医生一般建议患者长期复查观察即可，无需专门治疗。二、较大甲状腺结节（大于8mm）：1.若经甲状腺细针穿刺活检确定为恶性，或引发了甲状腺功能障碍、严重吞咽困难、呼吸困难等症状，这种情况比较严重，需手术切除；2.若结节较大但仍为良性，则不算严重。三、甲状腺囊肿：其与结节的不同在于内部是液体。通常甲状腺囊肿无明显症状，多为良性且无需治疗，少部分恶性囊肿则比较严重，需要手术切除。
总之，对于甲状腺结节囊肿，要根据具体情况来判断其严重程度，不同情况有不同的应对方式和处理措施。