灰指甲是因真菌感染甲板及甲床而引发，所以使用抗真菌药物来治疗通常效果较好。用于治疗灰指甲的抗真菌药物较多，在临床上可分为口服药物与外用药物这两大类。
一、口服药物：
1.伊曲康唑：能够有效治疗深部、皮下以及浅表的真菌感染，对灰指甲具备一定的治疗作用，不过可能会出现诸如胃肠道反应、头痛、头晕、高血压、水肿等不良反应情况。
2.特比萘芬：该药物口服后能在甲板处较长时间维持较高浓度，借此达到治疗目的，其不良反应相对较为轻微。
3.氟康唑：口服的吸收效果良好，不良反应发生率较低，但是需要注意的是，它可能会导致胎儿出现缺陷，因此孕期患灰指甲的话禁止使用此药。
二、外用药物：针对较为局限的灰指甲可以外用冰醋酸、碘酊或者阿莫罗芬搽剂。在用药之前适宜先去除病甲，之后再涂抹药物，这样便于药物吸收。也能够应用水杨酸软膏、尿素软膏进行外敷并包扎，待病甲软化后进行剥离拔除，然后再继续使用外用药物来治疗。
灰指甲的治疗周期较长，要彻底治愈比较困难，患者需要在医生的指导下坚持规范用药，如果是口服抗真菌药物，应当定期复查血常规、肝肾功能，一旦出现肝肾功能损害就要及时寻求医生的帮助。要是应用上述药物没有效果，或者已经出现甲床和指甲分离的症状，建议到医院就医，进行拔甲手术。患者要注意日常护理，定期对个人的衣物、鞋袜进行杀菌消毒，每天用温水洗脚，保持足部干燥，以抑制真菌滋生，避免出现治疗不彻底以及交叉感染的情况。
总之，灰指甲的治疗需综合考虑病情、药物选择、用药规范和日常护理等多方面因素，患者应积极配合医生进行治疗和管理。