医院检查尖锐湿疣主要通过以下多种方法：临床检查、醋酸白试验、皮肤镜、核酸扩增试验、病理学检查以及其他辅助检查手段。
一、临床检查：皮肤科的专科医生能够依据典型的皮肤损害来开展临床检查，进而可作出诊断。
二、醋酸白试验：此试验已在临床应用多年，但它并非是HPV感染的特异性试验，可能会出现假阳性和假阴性结果，在临床中更多地应用于治疗过程中对可疑皮损的鉴别。
三、皮肤镜：皮肤镜可以无创、快速且清晰地识别皮损的形态、增生的血管以及裸眼无法识别的结构。通常情况下，皮肤镜对于不典型尖锐湿疣和微小尖锐湿疣的确诊率能够达到90%以上。
四、核酸扩增试验：包含聚合酶链式反应（PCR）、荧光实时PCＲ、核酸探针原位杂交试验等，该试验能够直接检测标本中的HPV-DNA，是发现HPV感染较为可靠的方法，但不能将其作为判断痊愈的标准。
五、病理学检查：对于不典型皮损，在表皮浅层可观察到呈灶状、片状以及散在分布的空泡化细胞，也就是凹空细胞。这种细胞体积大、核深染，核周胞浆有不同程度的空泡化改变。在部分皮损的颗粒层细胞内，还可看到粗大的紫色包涵体颗粒。对于典型皮损，通常可不进行组织病理活检。
六、其他辅助检查手段：包括阴道窥器、阴道镜、肛门镜、直肠镜和尿道镜等，这些手段能够更好地暴露腔道部位的疣体，同时利用放大镜或阴道镜进行放大，也有助于诊断微小皮损。
总之，医院通过多种方法来检查和确诊尖锐湿疣，以确保准确诊断和有效治疗。