低位肛瘘指的是瘘管管道或创腔处于肛门外括约肌深层以下的肛瘘，其治疗方法通常有药物治疗与手术治疗等。具体情况如下：
一、药物治疗：
1.适用情况：适合存在流脓、红肿、疼痛等症状的低位肛瘘患者，或者是暂时不适宜进行手术的患者。
2.药物种类：治疗低位肛瘘的药物有很多，比如外用药如夫西地酸乳膏、莫匹罗星软膏、金黄膏等，以及抗生素如头孢地尼、甲硝唑、氧氟沙星等，这些药物可以起到活血、消肿、止痛的作用。但需要注意的是，这只是对症状的缓解，并不能彻底根治，之后仍有复发的可能。
二、手术治疗：
1.目的：是将瘘管切开以实现引流通畅，包含切开术和切除术。
(1)切开术：先通过探针查明瘘管走向以及内口位置，接着剔除瘘管管壁和坏死组织。这是治疗低位肛瘘常用的手术方式，操作简便且治愈率较高。
(2)切除术：适用于已经纤维化的低位肛瘘，即用电刀切开全部瘘管，将局部受到感染的瘘管壁以及部分感染组织完全切除，这样有利于新鲜肉芽的重新生长，从而达到治疗效果。
要知道肛瘘有一定的癌变几率，所以必须要及时就医，依据医生的评估和指导来进行相应的治疗。
总结：低位肛瘘可通过药物和手术方式治疗，药物治疗能缓解症状但易复发，手术治疗有切开术和切除术，各有适用情况和操作要点，且因肛瘘可能癌变，需及时妥善治疗。