咽喉炎和扁桃体炎在发病部位、临床表现及治疗等方面存在区别，具体如下：
一、发病部位：
1.咽喉炎主要涉及咽后壁、舌根、喉部等部位的黏膜充血、肿胀与增生。
2.扁桃体炎则是扁桃体出现急性充血甚至化脓。一般来说，咽喉炎通常不会引发扁桃体炎症，但扁桃体炎发作时往往会伴有咽喉部炎症。
二、临床表现：
1.细菌感染引发的咽喉炎多表现为咽痛，可能不发烧或仅有轻度发烧，主要症状包括声音沙哑、咽干、咽痒咳嗽、咽部异物感及烧灼感等。查体可见咽喉部充血，扁桃体无脓性分泌物。
2.病毒感染引起的咽喉炎会有发烧症状。化脓性扁桃体炎多表现为咽痛不严重，但往往伴有高热等症状。查体可发现单侧或双侧扁桃体有脓性物。
三、治疗：
1.病毒感染引起的咽喉炎常用中成药治疗，如蒲地蓝消炎口服液、双黄连口服液等，也可进行雾化吸入治疗。
2.细菌感染引起的急性咽喉炎一般可口服抗生素治疗，如阿莫西林胶囊、阿莫西林克拉维酸钾片、头孢拉定、头孢克洛等。
3.化脓性扁桃体炎常常需要静脉滴注敏感抗生素进行消炎治疗，比如用头孢类抗生素加甲硝唑治疗。
总之，要准确区分咽喉炎和扁桃体炎，并根据具体情况采取相应的治疗措施。