治疗脂溢性皮炎常用的药物有外用药物和口服药物。一般来说，外用药物是常用的起始治疗方式。
外用药物治疗
糖皮质激素：
弱效糖皮质激素： 像氢化可的松乳膏，适用于面部、婴儿等皮肤较薄嫩部位的脂溢性皮炎，能起到抗炎、抗过敏的作用，可缓解瘙痒等症状。中效糖皮质激素： 例如曲安奈德益康唑乳膏，对于炎症较明显的脂溢性皮炎有较好的疗效，但使用时间一般不宜超过2-4周，避免长期使用引起皮肤萎缩等不良反应。
抗真菌药物：
酮康唑乳膏： 因为脂溢性皮炎常伴有马拉色菌等真菌感染，酮康唑能抑制真菌细胞膜麦角固醇的合成，从而发挥抗真菌作用，减轻炎症反应。一般每天使用1-2次，连续使用2-4周。益康唑乳膏： 对皮肤癣菌、酵母菌等有抗菌活性，可用于脂溢性皮炎合并真菌感染的情况，涂抹后轻轻按摩至吸收，一日1-2次。
口服药物治疗
B族维生素：
维生素B6： 脂溢性皮炎患者常伴有维生素B6缺乏，补充维生素B6有助于调节皮脂腺分泌。一般可每日口服1-2片，每片10mg左右，长期服用一般不会有严重不良反应，但最好在医生指导下使用。
抗组胺药物：
氯雷他定： 如果脂溢性皮炎患者伴有明显瘙痒，氯雷他定可以缓解瘙痒症状。成人一般每天服用1次，每次10mg，它可以选择性地阻断组胺H1受体，发挥抗过敏作用。不过个别患者可能会出现乏力、头痛、嗜睡等不良反应，用药期间应避免驾驶或操作机械。