血吸虫病的临床症状因感染阶段和病情轻重有所不同。急性血吸虫病患者在接触疫水后数天至 6 周左右可能出现症状，如发热，体温多在 38~40℃，可伴有畏寒、寒战等。
急性期症状
发热表现： 发热是急性期较突出的症状，热型以间歇热最常见，体温波动较大，一般持续 2 周左右，部分患者可能持续数月。同时还可能伴有乏力、盗汗、食欲减退等全身症状。胃肠道症状： 多数患者有腹痛、腹泻，轻者每日 3~5 次，可带血和黏液；重者腹泻每日 10 余次，甚至出现脓血便。部分患者可有肝脾肿大，左叶肝大较常见。
慢性期症状
无症状型： 此型较多见，患者一般没有明显症状，仅在粪便检查或体检时发现虫卵。有症状型： 以腹痛、腹泻为常见表现，病程长者可出现贫血、消瘦、体力下降等。部分患者会有肝肿大，早期以左叶为主，晚期则右叶明显肿大且质地变硬。
晚期症状
肝硬化表现： 患者可出现门静脉高压症，表现为脾肿大、腹水、食管胃底静脉曲张破裂出血等。腹水是晚期血吸虫病肝功能失代偿的表现，患者腹部膨隆，腹胀明显。食管胃底静脉曲张破裂出血可导致大量呕血和黑便，严重时可危及生命。其他表现： 儿童患者可能出现生长发育障碍，表现为身材矮小、性发育迟缓等。