脸上长瘊子是由人乳头瘤病毒（HPV）感染皮肤黏膜所引起的良性赘生物，可通过以下方式治疗：
1.物理治疗：包括冷冻治疗、电灼疗法、激光治疗等，这些方法可以直接破坏疣体，适用于疣体较小的情况。
2.外用药物治疗：可以使用咪喹莫特乳膏、氟尿嘧啶软膏等药物涂抹在疣体上，具有一定的治疗效果。
3.手术治疗：对于疣体较大或药物治疗无效的情况，可以考虑手术切除。
需要注意的是，在治疗过程中，应避免搔抓疣体，以免造成自身接种传播。同时，要保持皮肤清洁，避免感染。如果症状持续不缓解或加重，建议及时就医，在医生的指导下进行治疗。此外，免疫力低下的人群更容易感染HPV并长瘊子，因此要注意加强锻炼，提高免疫力。