肾结石的治疗方案主要有以下几种。一般来说，对于直径小于0.6厘米的肾结石，可先尝试药物排石。常用的排石药物有枸橼酸氢钾钠等，通过碱化尿液等作用帮助结石排出，患者每天需保证2000~3000毫升以上的饮水量，以增加尿量促进结石排出。
体外冲击波碎石治疗
原理：利用冲击波聚焦后作用于结石，使结石裂解成细砂状，然后随尿液排出体外。适用情况：适用于直径在2~2.5厘米以下的肾盂结石或肾下盏结石等。但如果结石过硬、肾功能不全等情况则不适合。治疗过程中患者可能会有轻微疼痛，但大多可耐受。
手术治疗
经皮肾镜碎石取石术
操作方式：在腰部建立一条从皮肤到肾脏的通道，通过肾镜找到结石后，用激光、超声等碎石工具将结石击碎并取出。适用情况：适用于较大的肾结石，如直径大于2.5厘米的结石，或者体外冲击波碎石失败的结石。该手术创伤相对较大，但能较彻底地清除结石。
输尿管镜取石术
操作方式：经尿道插入输尿管镜，找到结石后，用套石篮取出结石或用激光等碎石后取出。适用情况：适用于中下段输尿管结石等。对于一些较小的肾结石，如果结石移动到输尿管部位也可采用此方法。