阴茎流脓且小便尿道刺痛，主要考虑是非淋菌性尿道炎、淋球菌性尿道炎或阴茎癌所致。
一、非淋菌性尿道炎：
1.会导致患者小便后刺痛，伴有阴茎流脓症状。
2.治疗上可遵医嘱使用氟喹诺酮类药物，如左氧氟沙星、氧氟沙星等。患者需注意个人卫生，勤换洗衣物，保持外阴清洁干燥，避免食用辛辣刺激性食物。
二、淋球菌性尿道炎：
1.这是由淋球菌感染引发的泌尿生殖系统黏膜传染性疾病。患者会出现尿道口红肿、黏膜发痒、刺痛，伴有尿频、尿急、小便后疼痛，尿道口有大量白色或黄色黏稠分泌物。
2.治疗时可能需要静脉输注头孢曲松钠等以缓解症状。同时患者在治疗期间要禁止性生活，防止交叉感染。
三、阴茎癌：
1.虽然较为罕见，但也有发生可能，且其恶性几率高，早发现早治疗极为重要。
2.当出现阴茎流脓且小便尿道刺痛时，也可能是阴茎癌引起。
所以，有阴茎流脓且小便尿道刺痛症状的患者，应及时就医，积极配合治疗。治疗过程中要注意饮食清淡，忌烟酒，避免同房，注重个人私处卫生。