疱疹性咽峡炎主要由肠道病毒引起，治疗上一般以对症处理为主，通常病程在1周左右。
一般治疗措施
隔离休息： 患儿需隔离2周左右，避免交叉感染。同时要让患儿多休息，保证充足的睡眠，有助于身体恢复。清淡饮食： 给患儿提供清淡、易消化的食物，如小米粥、软面条等，避免食用辛辣、刺激性食物，以免加重咽部不适。
对症治疗药物
退热药物： 当患儿体温超过38.5℃时，可使用对乙酰氨基酚进行退热，它能通过抑制前列腺素合成来发挥退热作用，适用于3个月以上的儿童和成人。缓解咽痛药物： 可以使用含漱液，如生理盐水，用来清洁口腔，减轻咽部疼痛；也可以酌情使用布洛芬，它不仅能退热，还能缓解疼痛，但6个月以下婴儿使用需谨慎，要在医生指导下进行。
抗病毒治疗情况
常用药物： 目前对于肠道病毒感染引起的疱疹性咽峡炎，并没有特效的抗病毒药物。一般不推荐常规使用抗病毒药物，因为多数患儿可自行恢复。但对于重症患儿或有特殊情况的患儿，可能会根据病情评估使用干扰素等药物，不过干扰素的使用需要严格掌握适应证。不建议滥用： 家长不要自行给患儿使用抗生素，因为疱疹性咽峡炎是病毒感染引起的，抗生素对病毒无效，滥用抗生素还可能导致耐药菌产生等不良后果。
护理注意事项
口腔护理： 保持口腔清洁，饭后让患儿漱口，婴幼儿可以在喂奶后喂少量温水，清洁口腔。观察病情变化： 密切观察患儿的体温、精神状态等情况，如果患儿出现持续高热不退、精神萎靡、呕吐、抽搐等症状，要及时就医，可能提示病情加重，需要进一步处理。