乳腺囊肿的成因较为复杂，主要与内分泌紊乱、乳腺结构异常以及哺乳相关因素有关。内分泌紊乱方面，女性体内的雌激素水平异常升高时，可能会刺激乳腺导管上皮增生，导致导管扩张形成囊肿，约有50% - 70%的乳腺囊肿与内分泌失调相关。
内分泌紊乱因素：
激素水平失衡： 长期的精神压力大、生活不规律等情况，可能引起体内雌激素、孕激素比例失调。比如，雌激素相对过多时，会使乳腺组织过度增生，进而引发乳腺囊肿。像一些经常熬夜的女性，内分泌容易紊乱，患乳腺囊肿的风险可能会增加。月经周期影响： 在月经前，女性体内激素变化明显，乳腺组织会出现增生和复旧不全的情况，这也可能促使乳腺囊肿的形成。很多女性在月经前会感觉到乳房胀痛，部分人可能就存在乳腺囊肿的潜在问题。
乳腺结构异常因素：
乳腺导管堵塞： 乳腺导管如果发生堵塞，分泌物排出不畅，就容易在局部积聚形成囊肿。导管堵塞可能是由于先天性的导管发育异常，或者是炎症等原因导致导管狭窄、阻塞。例如，一些患有乳腺炎症的患者，炎症可能会波及导管，导致导管堵塞引发囊肿。腺叶或小叶结构改变： 乳腺的腺叶或小叶结构出现异常，也可能诱发乳腺囊肿。这种结构改变可能是局部组织的生理性或病理性变化引起的，使得乳腺组织的正常形态和功能受到影响，从而形成囊肿。
哺乳相关因素：
乳汁排出不畅： 在哺乳期，如果产妇的乳汁排出不顺畅，乳汁在乳腺内淤积，就可能形成囊肿。比如，有些产妇乳头发育不良，如乳头过小、内陷等，会影响乳汁的排出，增加乳腺囊肿的发生几率。据统计，约有20% - 30%的哺乳期女性可能会因为乳汁排出不畅出现乳腺囊肿。乳腺导管扩张： 哺乳期乳腺导管扩张也可能导致囊肿形成。乳汁的长期刺激以及导管自身的变化，使得导管扩张，里面的乳汁等物质积聚形成囊肿。