肚脐眼处长期隐隐作痛可能由以下原因引起：
1.脐炎：脐部感染细菌后，会引起炎症反应，导致肚脐眼处疼痛，通常还会伴有红肿、分泌物增多等症状。
2.脐尿管未闭：如果脐尿管未完全闭合，会导致脐部与膀胱相通，容易发生感染，从而引起肚脐眼处疼痛。
3.腹部受凉：肚脐眼处皮肤较为薄弱，若长期受到寒冷刺激，可能导致腹部肌肉痉挛，从而出现肚脐眼处疼痛。
4.消化不良：消化不良时，食物在胃肠道内积聚，产生大量气体，可能引起腹部胀痛，疼痛可能放射至肚脐眼处。
5.其他：如胃肠道疾病、腹部肿瘤等，也可能导致肚脐眼处长期隐隐作痛。
针对肚脐眼处长期隐隐作痛的情况，可以采取以下措施：
1.保持脐部清洁干燥，避免用手搔抓或抠挖脐部。
2.注意腹部保暖，避免着凉。
3.调整饮食，避免食用辛辣、油腻、刺激性食物，以及易产气的食物。
4.如疼痛持续不缓解或伴有其他症状，如发热、呕吐、腹泻等，应及时就医，进行相关检查，明确病因，并在医生的指导下进行治疗。
需要注意的是，以上内容仅供参考，具体情况可能因人而异。如果对肚脐眼处长期隐隐作痛的原因和处理方法有任何疑问，建议咨询医生或专业医疗人员。