肌肉酸痛的原因有多种。一般来说，运动过量是常见原因之一。比如长时间不运动后突然进行大量运动，像一次性跑步超过5公里，就可能导致肌肉产生乳酸堆积，从而引发酸痛，这种情况在运动后的1 - 2天较为明显。
运动相关因素
运动强度过大： 当进行高强度的无氧运动时，肌肉在短时间内缺氧，会进行无氧呼吸产生乳酸，大量乳酸堆积就会引起肌肉酸痛。例如进行100米冲刺跑这类短时间高强度运动后，肌肉酸痛感可能较为明显。运动时间过长： 持续运动超过1小时，肌肉持续工作，也容易出现疲劳和酸痛。像连续骑行2小时以上，腿部肌肉就可能因过度疲劳而酸痛。
疾病因素
感染性疾病： 流感等感染性疾病可能伴随肌肉酸痛症状。一般流感患者除了发热、咳嗽等症状外，约有30% - 50%会出现全身肌肉酸痛，尤其是四肢肌肉。自身免疫性疾病： 类风湿关节炎也会导致肌肉酸痛。这类患者的肌肉酸痛通常是对称性的，还可能伴随关节肿胀、僵硬等症状，且病情会反复发作。
不良姿势与劳损
长期不良姿势： 长时间弯腰驼背工作，会使背部肌肉长期处于紧张状态，容易引发肌肉酸痛。比如长时间伏案工作，每天伏案超过6小时，背部肌肉就可能因姿势不良而酸痛。慢性劳损： 长期从事重体力劳动，手部、腰部等部位的肌肉容易出现慢性劳损，导致酸痛。像建筑工人长期搬举重物，腰部肌肉慢性劳损，经常会有酸痛感。